某国外交官在与一个要求避难的程序员代田会面,但被六课逮捕,行动中,此外交官突然被来历不明的杀手击毙,而杀手也逃之夭夭。此次行动其实是九课的杰作,因为政府不便出面,所以瞒者六课而命令九课消除麻烦。
某日,外相的翻译被人动了手脚,九课在她的电子脑中发现了某种病毒,作案手法似乎是传说中的“傀儡王”的风格。傀儡王是一个被通缉的国际罪犯,他利用侵入大脑的方式,来指使别人为其工作。几天后,素子他们发现有一个黑客经常入侵一些公共设施的电脑,于是九课布置陷阱,抓获了这个身为清洁工人的黑客与给其程序的人。可是审问过程中,他们却发现此人的记忆早已被人所篡改,他的动机其实也是在别人的暗示之下进行的。而且那个提供程序的人的记忆也被人改动了,这两人完全都不记得自己的过去、自己的家人,甚至自己的名字,他们就象一颗被人摆弄的棋子。
素子已经陷入了迷茫的阶段,看着商店橱窗里摆放的衣服人偶,她思考身为人类究竟该有何定义,难道这身体和人偶没有区别吗?记忆也可以更改,那么身为人类到底有哪些是属于自己的呢?人类一生的记忆,与庞大的信息世界,就好比一滴水和大海的程度。案件仍然没有停止,素子却有种仿佛被人凝视的感觉,她并不清楚这是哪里的视线。紧接着,麦格公司与政府合作生产的一个完全电脑人逃离公司,在夜间被车撞倒。九课接受了她的躯体。六课也派人来,并声称此电脑人躯体内有他们追踪多时的傀儡王,于是一乾人等开始检查该电脑人的躯体。躯体内的傀儡王表明自己不是 AI,虽然他的代号是“2501计划”,但是他已有了察觉自我存在的意识。此时,九课遭到袭击,电脑人躯体被抢走。素子跟踪劫匪,并在一处破旧的废墟找到了被六课藏匿的2501。
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