序篇维新政府建立后的某一天,在一个小村庄里,剑心遇见了一位美丽的少女神谷熏。交谈中得知有个叫此留间五兵卫的人冒充拔刀斋在村里作恶,阿熏手拿竹刀与之拼命,但不是对手。五兵卫手起刀落,眼看阿熏性命难保,千钧一发之际,一个人影风驰电掣般闪过,五兵卫劈了个空,而阿熏已在一位英俊的红发少年怀中。
阿熏见救自己的竟然是一位拿逆刃刀的少年武士,而且还说自己就是杀人无数的刽子手拔刀斋,她很想知道剑心为什么不再杀人,她也很想了解剑心的过去,她希望剑心结束流浪生活,在道场安家,用剑去实现保护受苦受难的人的愿望。阿熏把自己的身世告诉了剑心,她父亲是神谷活心流传人,一直遵循以剑活人,以剑救世的宗旨,剑术高超却从不使用真剑,专门锄强扶弱,幕末乱世中,一名弟子受利益驱使,杀死了她父亲,如今道场解散,门下一个弟子也没有, 但她没有气馁,决心独力支撑大局,并将父亲活人的剑道精神发扬光大,以保护弱者。剑心深深地被阿熏这种不屈不挠的精神所感动,尤其觉得她的志向与自己很相近,于是他决定留下。
此后,剑心最真实的感情世界只向一个人敞开,她就是神谷熏。剑心在道场里过着和平宁静的生活。不久,他遇到并解救了命中注定的几位好朋友,一个是明神弥彦,他父亲是士族,因与人有过隙而被杀,死后留下大量债务,追债者要弥彦还钱,弥彦无力偿还,只能去当小偷,后被剑心解救,追债的无赖也被打得落花水。弥彦决心成为像他父亲一样出色的人,于是投身神谷道场门下学习剑术,不过和师傅阿熏是对小冤家。
另一个人是相乐佐之助,他自幼父母双亡,是个孤苦零仃的孤儿,后来被维新组织之一的赤埔队收留,相乐队长象父亲一样照顾他,于是他跟随队长姓相乐,并跟随赤埔队四处转战,维新胜利后,政府过桥抽板宣布赤埔队非法,并予以取缔,赤埔队苦战不力,全军覆没,只剩下佐之助和另外一个小孩——阿黑幸免,相乐队长带着佐之助逃到悬崖边,自己冲回去与政府的步枪队肉搏,当场牺牲,佐之助趁乱逃脱。
经历这一劫难,佐之助对维新政府恨之入骨,但苦于能力有限,只能找别人打架来发泄怨气,成为远近闻名的小流氓,后被剑心打败并晓以大义,终于明白了相乐队长是为了国家解放,人民幸福而浴血奋战,他的在天之灵是不希望看到自己这样堕落的,于是,他和剑心一道立志要与破坏安定生活的坏人作斗争,走上了正道还有一位叫高荷惠的女子,她的出现曾经令阿熏醋意大生,她因为不满主子强迫她制造鸦片而逃走,终于在剑心那里得到保护……,最后成了远近闻名的名医。有朋友,当然也有敌人。
四乃森仓紫,前幕府宫廷间谍组织的首领,当时间谍组织因得宠而势力强大。仓紫更是年少得志,剑术高强。但在与长洲维新派的血战中遭到惨败,最终,逆历史潮流而行的间谍组织土崩瓦解,仓紫因此对维新运动尤其是代表人物剑心恨之入骨。而且,成为最强的人是仓紫毕生的梦想,而当时要得到这一名誉,就是要打败拔刀斋。他要在维新政府眼皮底下重整旗鼓,再建立一支间谍队伍,以此作为挑战剑心,挑战政府的资本。于是他和秘密生产鸦片的商人观柳合作,观柳就是强迫高荷惠制造鸦片的人。
但仓紫的计划因为剑心的阻碍和观柳的出尔反尔而失败,反而令苦心培养的部下全部丧命。还有前新撰组的冷血杀手刃卫,尽管不再需要刽子手的时代已经到来,但他凶残的本性没有丝毫改变,他劫持了神谷熏并向剑心挑战,唯一的目的只是为了满足战斗和杀人的欲望,这样的人当然没有好下场。但是,最可怕的敌人还是和剑心同时代的刽子手,志志雄真实……
浪客剑心粤语全集人物图