奈克斯特奥特曼全集讲述的是前往调查地落在太平洋的不明飞行物的海上自卫队二尉--有恸贯文,突然遭遇到蓝色光芒,而在这光芒影响下其细胞产生突然异变而变成凶恶怪兽"THE ONE",并四处袭击。防卫队的攻击依然无效,之后他在防卫厅的特殊机关BCST(对生物恐怖活动研究机关)的监视下脱逃而失去踪迹……
另一方面,航空自卫队F15J战机驾驶员-真木舜一,为了患有先天性疾病的儿子继梦在一起,因而而决定辞职。就在最后一次飞行时,真木在空中跟一个神秘的红色光芒在空中发生冲撞。此事跟"THE ONE"事件相隔了3个月,真木奇迹生还,然后转职成民航机飞行员,展开了新生活。
奈科斯特奥特曼全集海报
对这样的真木还是有机关非常关注,尤其是BCST中的化学担当官--水原沙罗。BCST将真木强制带走,在废工厂中搭建的BCST研究室进行身监视禁锢。此时行踪不明的怪"THE ONE"像被某种东西吸引而现身了,真木感觉到他的气息,开始变得焦虑、急躁,非常痛苦。可惜,BCST还是没有帮助真木。
之后,THE ONE出现了,防卫队虽然用特殊子弹射死了他,但THE ONE拥有吸收各种生物进化的能力,死了之后依然能吸收了大量的生物进化,从而使到THE ONE复活并巨大化。残暴的THE ONE不断攻击,令到真木失控,最终撞坏了地牢的铁门,出现在THE ONE面前。遭受"THE ONE"攻击而濒死的真木,身体发生了变化,在红光的力量之下变身了!
诺亚奥特曼形态
诺亚·奥特曼,是奈克瑟斯奥特曼的最终形态。作为第5名继承光的适能者孤门一辉,变身所特有的标志形态。 在背部伸缩自如的“诺亚之翼”使得诺亚有超越空间和时间的能力。拥有火焰包裹的拳头“诺亚地狱火”和左拳靠在右臂后发出的超强力光线“诺亚闪电”等许多神秘的能力。