棋魂国语版又名棋灵王讲述的是小学六年级的进藤光为了赚些零用钱,跑到爷爷家里寻宝,偶然翻出了一个旧棋盘。接触棋盘的一瞬间,附身于棋盘中的平安时代棋士——藤原佐为的灵魂进入了小光的体内。佐为将围棋视为生命,在他的熏陶下,小光也逐渐对围棋产生了兴趣。
光在围棋会所结识了棋坛名人之子——塔矢亮。为了测试佐为的实力,光贸然与亮对弈,结果小胜对手。他不知道塔矢亮的身份,误以为佐为棋力平常,对此深为不满。然而塔矢亮却大受打击,失意至极。数日后,亮再次向光挑战,虽然他对光藐视围棋的态度十分气愤,但是无奈再次惨败在佐为手下。
光应朋友之邀,前往叶濑中学参加校庆活动。他冒充初中生加入叶濑中学团队参加校际围棋赛。在团体赛的决赛中,借助佐为的力量连克强敌,结果叶濑中学力挫名校海王中学,夺得了冠军。可惜有人揭发小光还是个小学生,因此被大赛取消了名次。
不久后,光升入叶濑中学,并加入了围棋部。与此同时,塔矢亮也考入了海王中学,为了和光对局,他专程前往叶濑中学挑战。但是,光深知自己远远不是亮的对手,断然回绝。亮得知光即将参加校际围棋比赛后,为了与他一决高下,不惜加入海王中学围棋部。
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