我的女神第二季全集讲述的是故事的男主角叫森里萤一,一个普通的大学生。一天,独自看守宿舍的萤一拨错了电话,幸运的是,他接通的是女神事务所。一位美丽的女神通过镜子出现在他面前,答应实现萤一的一个愿望,她就是故事的女主角贝璐丹迪。因为个子不高的缘故,萤一与女性没有缘分,所以他许愿希望能有一位像贝璐这样的女性常伴身边。贝璐误以为萤一希望自己能陪在他身边,于是接受了萤一的愿望答应与他永远在一起。
有这么美丽而又法力强大的女神在身旁,萤一的生活从此变得丰富多彩。之后,萤一的妹妹森里美惠,贝璐的姐姐女神乌璐德和妹妹女神斯库鲁德先后住进了他们临时的家。虽然有反面角色一级非限定魔玛拉时而捣乱,萤一和贝璐的恋爱之路却并未受此影响。