五更龙宝宝国语版宠物店的老板叶三,为讨女儿初叶开心,不惜花重金购入一只无比奇怪而又神秘的蛋,并且亲自代孕孵化。不久,可爱的“小婴儿”--五更出生了,出人意料的是顽皮捣蛋的五更竟然是只恐龙宝宝,被出生后的额五更第一眼看到的初叶,成了五更的妈妈。淘气的五更将高谷商店街搞得不得安宁,唯一能够让它停止的是“蓝莓果酱”。由于博士的时光机实验,把初叶、五更一行人及整条高谷商店街莫名其妙地卷进了侏罗纪时代,于是大家开始了另类的冒险生活。后来,大家终于有希望回到现实世界中,不料恐龙岛却被黑暗小子侵占,变成了黑暗而恐怖的世界。